Después de percatarme de que el problema del path de las librerias estaba en el initrd. He aprendido a editar el initrd más o menos automáticamente.
Justo en este punto del script llamado live:
mount -t ${UNIONTYPE} -o noatime,dirs=/cow=rw:${rofsstring} \
${UNIONTYPE} "${rootmnt}" || panic "mount ${UNIONTYPE} on \
${rootmnt} failed with option noatime,dirs=/cow=rw:${rofsstring}"
+ /root/sbin/ldconfig.real
+ chmod 600 /root/etc/fstab
+ chmod 600 /root/etc/live.conf
+ chmod 600 /root/etc/environment
+ chmod 600 /root/etc/network/interfaces
es dónde empiezan a fallar las librerias.
Creo que no es ese mount que se ve sino otro anterior el que provoca el fallo. Seguramente porque parte del sistema se remonta en otra parte y de alguna manera (me imagino yo) ld debe guardar el inodo de los directorios a buscar y no su ruta.
Ejecutar ldconfig desde el directorio /root (en / no hay nada parecido) es la mejor idea que se me ha ocurrido para salir del paso.
Adrián